操作说明:
收集细胞:
每个免疫沉淀反应大约使用 10 6-10 7 的哺乳动物细胞(约一个 10 厘米培养皿) 表达mCherry的融合蛋白。吸出生长培养基、向培养皿中加入 2 毫升预冷的 PBS 洗涤细胞 2 次,利用细胞刮或胰酶消化的方法收集贴壁细胞,细胞转移到离心管,500 g离心 3-5 分钟并丢弃上清液。
细胞裂解:
1.用 1.0 mL 预冷的裂解缓冲液重悬细胞,在裂解缓冲液中加入蛋白酶抑制剂。对于膜蛋白或核/染色质蛋白,可使用 RIPA 裂解液,或普通 IP 裂解液结合超声破碎细胞的方法。
2.把离心管放置在冰上 30 分钟, 可以每 10 分钟充分吹打一次,或者在 4 度旋转混合仪上裂解。
3.细胞裂解产物在 4℃, 20,000 g 条件下离心 15 分钟,转移裂解产物到一个新的预冷管中,丢弃沉淀。
注意:此时细胞裂 解产物可以放在-80℃进行长期储存。
平衡珠子:
4.振荡混匀 mCherry Nanobody Agarose Beads,吸取 20μl slurry 到 500 μl 预冷的裂解缓冲液中, 在 4 ℃, 2,500 g条 件下离心 3 分钟,丢弃上清液。 (此步骤可选,并建议吸取 20μl 珠子悬液 时剪掉枪头的前端)
结合蛋白:
5. 将细胞裂解产物加入到平衡的 珠子中(如果未做第 4 步,可在细胞裂解产物中直接加入 20μl 珠子悬液),在 4 ℃冷柜中的旋转混合仪上结合 1 h,也可以根据需要延长结合时间。如果需要,保存 50 μl 的裂解 产物作为 input 进行免疫印迹分析。
6. 在 4 ℃, 2,500 g 条件下离心 3 分钟,丢弃上清液。
清晰珠子:
7. 用 1.0 mL 预冷的裂解缓冲液中洗涤珠子,在 4 ℃旋转混合洗涤 5 min,在 4 ℃, 2,500 g 条件下离心 3 分钟,丢弃上清液并重复洗涤 2 次。(可选: 在第二次洗涤的步骤中增加盐浓度到 500 mM)。
洗脱蛋白:
方法一:
8. 加入 40μl 2X SDS-sample buffer 重悬珠子。在 95℃条件下加热 10 min,把免疫沉淀复合物从珠子上游离出来,然后在 4 ℃, 2,500 g 条件下离心 3 分钟收集上清, 进行免疫印迹分析。
方法二:
9. 加入 50μl 0.2 M pH2.5 的甘氨酸洗脱结合的蛋白,建议孵育时间 30 秒,并不断混匀, 随后 离心,转移上清液到新管中, 为了中和酸性的甘氨酸, 需添加 5μl 1.0 M Tris(pH10.4)。注意:为了提高洗脱效率可以重复这一步。